不同16S rDNA靶序列PCR-DGGE分析油页岩细菌多样性

作者：蒋绍妍; 王文星; 薛向欣; 杨寿浩

来源：东北大学学报(自然科学版), 2014, (07): 1033-1038.

• 油页岩
• 16S rDNA
• PCR-DGGE
• 细菌多样性
• 靶序列 oil shale
• 16S rDNA
• PCR-DGGE
• bacterial diversity
• target sequences

为全面了解油页岩细菌群落组成结构,同时筛选出适于油页岩PCR-DGGE的最佳引物,采用改进SDS高盐提取法,提取抚顺西露天矿油页岩微生物总DNA,并用968F/1401R,338F/518R,341F/907R和1055F/1406R,对16S rDNA V6-V8,V3,V8和V9区进行PCR-DGGE分析.结果表明,4组引物均能较好扩增出目的基因,但不同靶序列对多样性检出有显著影响(P<0.001);与其他引物相比,968F/1401R和338F/518R获得的指纹图谱物种丰富度更高,检出细菌类群更丰富,较适合油页岩样品.油页岩细菌群落组成较简单,优势细菌包括不动杆菌属、假单胞菌属和埃希氏...

• 出版日期2014
• 单位东北大学