癌症基因组图谱计划数据及分析

作者：邓祯祥; 李金明

来源：中国肿瘤临床, 2013, (05): 349-353.

• 癌症基因组图谱
• 数据类型
• 数据分析
• 数据挖掘 cancer genome atlas
• data category
• data analysis
• data mining

人类癌症细胞中通常藏匿着多种引起恶性病变的染色体变异,核酸替换和表观遗传修饰。癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)计划的目标是获取、刻画并分析人类癌症中大规模、多种变异的分子特征,并且为癌症研究者迅速地提供数据。本文对TCGA数据的四个产生流程以及包含的癌症种类、数据类型、数据水平、分析流程和常用的几种分析工具等进行阐述,同时以卵巢癌(ovarian cancer)为例详细介绍了TCGA数据在突变分析、拷贝数分析、表达分析和通路分析等方面的应用,并对TCGA研究团队近几年有关胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)的研究方法和结果以及已经完成分析的...

• 出版日期2013-12-11
• 单位南方医科大学