大豆基因组GmGAI同源基因的生物信息学分析

作者：宋仙萍; 赵琳; 张彦威; 卢清瑶; 谷月娇; 李文滨

来源：大豆科学, 2012, 31(06): 869-873+877.

• 大豆
• GAI基因
• DELLA结构域
• GRAS结构域

利用Phytozome数据库、NCBI站和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycine max)基因组中GAI(GA insensitive)同源基因进行生物信息学分析,发现大豆GAI基因有7个拷贝,都不含有内含子,分别分布于第4、5、6、8、10、11和18号染色体上,它们都属于GRAS家族,都存在DELLA(34-106)和GRAS(158-513)2个结构域。氨基酸序列比对和系统进化树分析表明,大豆GAI的7个拷贝进化距离并不是最近的,而是分别有与之最近的其他物种,推测大豆GAI的7个拷贝在进化的过程中功能上发生了一些变化,对植物的生长发育可能会产生不同的影响。

• 出版日期2012
• 单位农业部; 东北农业大学