Apicidin选择性抑制ClassⅠ HDACs分子动力学研究

作者：李晓晖; 赵俊伟; 滕虎; 西野宪和; 修志龙

来源：高等学校化学学报, 2010, (02): 374-378.

• 组蛋白脱乙酰酶抑制剂
• 组蛋白去乙酰化酶(HDACs)
• 分子动力学
• 同源模建
• 分子对接 Apicidin
• Histone deacetylase
• Molecular dynamics
• Homology modeling
• Molecular docking

采用模拟方法研究组蛋白脱乙酰酶抑制剂(Apicidin)选择性抑制组蛋白去乙酰化酶(Histone deacety-lases,HDACs)中的HDAC1和HDAC8.通过HDAC8晶体结构同源模建HDAC1三维结构模型,将Apicidin分别与HDAC1和HDAC8对接并进行分子动力学模拟,结果表明,HDAC1活性口袋入口处的Arg270是Apici-din-HDAC1形成稳定结构的重要因素;HDAC1中Tyr303及His178与Apicidin形成2个持续存在的氢键,而在HDAC8中未发现,这是Apicidin选择性抑制HDAC1高于HDAC8的另一重要原因.

• 出版日期2010
• 单位大连理工大学