基于网络药理学和分子对接探讨杜仲-牛膝药对治疗强直性脊柱炎机制

作者:李舒; 万磊*; 刘健; 黄传兵; 李方泽; 胡赛赛; 陈莹莹; 程静; 周健
来源:云南中医中药杂志, 2023, 44(04): 60-67.
DOI:10.16254/j.cnki.53-1120/r.2023.04.024

摘要

目的 运用网络药理学和分子对接探讨杜仲-牛膝药对治疗强直性脊柱炎(AS)的关键靶点和分子机制。方法 利用TCMSP数据库检索杜仲-牛膝药对的活性成分,预测其对应靶点;利用GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD、PharmGkb数据库检索AS疾病相关靶点,利用Uniprot数据库将预测靶点和疾病靶点名称标准化后筛选出交集靶点,利用Cytoscape3.9.1绘制并分析中药-成分-靶点-疾病网络图。将共同靶点导入STRING数据库获得蛋白质互作网络并利用CytoNCA筛选出核心靶点。将共同靶点导入富集分析库(Metascape)数据库进行GO、KEGG富集分析。利用Auto Dock Tools1.5.7软件进行分子对接。结果 杜仲-牛膝有效活性成分35个,预测对应靶点150个,疾病相关靶点1914个,主要活性成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、汉黄芩素,核心靶点为白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素1β(IL-1β)、前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、C-X-C基序趋化因子配体8(CXCL8)。富集分析方面:GO BP主要包括细胞对脂质、有机环化合物和脂多糖反应等;GO MF主要包括细胞因子活性、细胞因子受体结合和受体-配体活性等;GO CC主要包括转录调节复合物、RNA聚合酶II转录调节复合物和膜筏等。KEGG主要包括免疫系统中的细胞因子信号传导通路、白介素相关信号通路、肿瘤坏死因子相关信号通路等。分子对接结果表明主要活性成分可以和核心靶点结合,结合构象稳定。结论 杜仲-牛膝可能通过多种有效成分、多个作用靶点和信号通路发挥抗炎、免疫调节、止痛等生物作用,进而具有治疗AS的作用。

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