Illumina高通量测序技术分析早产儿出生后肠道菌群变化的初步研究

作者：陈娜; 杨毅; 张澜; 方剑火; 郎继东; 曹云; 田埂

来源：中国循证儿科杂志, 2014, (05): 359-364.

DOI：10.3969/j.issn.1673-5501.2014.05.007

• 早产儿
• 肠道菌群
• 败血症
• 高通量测序 Preterm infants
• Gut microbiota
• Sepsis
• High-throughput sequence

目的初步探讨NICU早产儿出生后肠道菌群变化特征及其与败血症的关系。方法以复旦大学附属儿科医院NICU住院的早产儿为研究对象,于出生后第1天采集胎粪,之后于每周龄时或评估败血症时采集粪便样本,直至出院或生后8周。采用Illumina高通量测序技术对粪便样本中所有细菌的16S rRNA-V3区进行DNA测序,应用MG-RAST V3.3.6分析和统计样品序列数目、操作分类单元(OTU)数量,分析肠道菌群物种丰度和分布,并进行聚类分析。结果 3例早产儿共采集生后1、7、14和21 d的12份粪便样本,其中5份样本PCR扩增失败,7份样本(例1生后14、21 d;例2生后7、21 d;例3生后7、1...

• 出版日期2014
• 单位清华大学; 复旦大学附属儿科医院