转录因子THAP1在人肺泡Ⅱ型上皮细胞中结合靶基因的谱系分析

作者：丁蓉; 胡毓华; 何思思; 陆超

来源：南京医科大学学报(自然科学版), 2015, (09): 1200-1204+1215.

• 高通量测序
• A549细胞
• THAP1
• 染色质免疫共沉淀实验 high-throughput sequencing
• A549 cells
• THAP1
• Ch IP

目的 :确定转录因子THAP1的靶基因,为新生儿肺损伤的治疗寻找新策略。方法 :利用THAP1抗体进行染色质免疫共沉淀实验(chromatin immuno-precipitation,Ch IP),将富集到肺泡Ⅱ型上皮细胞来源的肺腺癌细胞A549上的DNA样品进行高通量测序,对得到的核苷酸序列进行生物信息学分析。结果:共得到20 417个THAP1结合位点的核苷酸序列片段,对应9 688个结合的靶基因,THAP1结合的主要区域分布在基因间区、内含子区和启动子区。其中包含1 051个基因的启动子区。将THAP1结合于启动子区的基因进行基因功能(gene ontology,GO)注释,表明THA...

• 出版日期2015
• 单位南京医科大学第一附属医院