小麦穗部组织EST-SSR标记引物开发及其在小麦遗传多样性分析中的应用

作者:刘泽涛; 苑少华; 杨迪; 王玉昆; 张立平; 赵昌平; 刘丽华; 李宏博; 庞斌双
来源:麦类作物学报, 2013, 33(06): 1093-1099.
DOI:10.7606/j.issn.1009-1041.2013.06.005

摘要

为了筛选光温敏雄性不育系(PTGMS)小麦穗部的EST-SSR分子标记,探讨其EST-SSR标记用于小麦品种遗传差异研究的可行性,用SSRSCAN软件对PTGMS小麦穗部的3 264条EST序列进行SSR位点查找,结果得到108条含有SSR标记的序列。设计64对引物并进行PCR扩增及非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳。结果显示,64对引物中有41对能在42个小麦品种中扩出PCR条带,有多态性条带的为36对,具有较高的扩增效率。聚类分析结果显示,42个小麦品种的遗传相似系数在0.64~0.87之间,3个PTGMS小麦品种具有较高的遗传相似系数。

全文