大豆MIR156基因家族起源与进化模式研究

作者：朱荣胜; 金会会; 王志豪; 陈庆山

来源：东北农业大学学报, 2016, 47(2): 8-15.

DOI：10.3969/j.issn.1005-9369.2016.02.002

• 基因家族
• 复制模式
• Ks值
• 大豆

MicroRNA(miRNA)是小分子RNA,参与靶基因转录后调控,长度通常为20～22 nt.MIR156基因在植物中分布广,是目前已知第一个与植物年龄有关的小分子RNA,表达量随植物年龄增长而逐渐减少,对植物生长发育起重要调控作用.研究基于古多倍体大豆基因组共线性分析,结合miRBase收录数据和预测获取的基因,从进化角度对该基因家族进行系统分析.通过对大豆MIR156基因家族成员分布、复制模式、扩张模式和分子系统发育分析,揭示这一古老基因家族基本起源模式.结果表明,该家族由多个祖先基因起源,以全基因组复制及大片段复制等方式发展.研究从方法和结论上对系统分析植物小分子RNA起源和进化具有重要意义.

• 出版日期2016
• 单位东北农业大学; 生命科学学院