ABEEM浮动电荷分子力场在含离子体系中的发展和应用

作者：宫利东

来源：中国科学:化学 , 2013, (05): 519-535.

• 离子水合
• 金属蛋白
• 浮动电荷分子力场
• ABEEM/MM
• 量子化学计算
• 分子动力学模拟 ion hydration
• metalloproteins
• fluctuating charge molecular force field
• ABEEM/MM(atom-bond electronegativity equalization method/molecular mechanics)
• quantum chemical calculation
• molecular dynamics simulation

离子水合及生物分子体系内离子选择性的微观作用机制是人们长期探索的重要课题,其难点在于如何合理精确地描述上述体系内的离子-水、离子-生物分子等各种相互作用.本文主要总结近年来原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM)在含离子体系中的发展和应用,包括离子水溶液、金属蛋白、离子-核酸碱基体系的研究.我们优选相关参数,构建上述体系的势能函数,并对气相水合离子团簇、离子水溶液、金属蛋白、离子-核酸碱基体系进行研究,模拟其结构、活性、热力学和动力学等性质.研究和比较结果表明,我们的ABEEM浮动电荷力场总体上优于其它力场方法,其精度可达到或接近高水平从头计算MP2方法.这为进一步探讨生物分子体...

• 出版日期2013
• 单位辽宁师范大学