大豆基因组GmRAV同源基因的生物信息学分析

作者：赵琳; 罗秋兰; 高阳; 滕卫丽; 李海燕; 陈李淼; 李文滨

来源：中国油料作物学报, 2011, (06): 550-554.

• 大豆
• RAV
• 光周期
• AP2/ERF结构域
• B3结构域 Soybean
• RAV
• Photoperiod
• AP2/ERF domain
• B3 domain

利用Phytozome数据库、NCBI网站,和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycine max)基因组中RAV同源基因进行了生物信息学分析,发现大豆RAV基因有4个拷贝,分别分布于第1、2、10和20号染色体上;RAV蛋白含有AP2/ERF(53～108)和B3(172～286)结构域。豆科植物大豆、东方山羊豆和苜蓿RAV蛋白亲缘关系较近。大豆的RAV基因4个拷贝中,Glyma01g22260与Glyma02g11060亲缘关系最近并且与苜蓿聚为一类,GmRAV和Gly-ma20g32730的亲缘关系也很近,并且与东方山羊豆聚为一类。推测大豆4个RAV拷贝在进化过程中功能上发...

• 出版日期2011
• 单位东北农业大学; 大豆研究所