辣椒EST-SSRs的分布特征及在品种多样性研究中的应用

作者：魏兵强; 刘飞云; 马宗桓; 陈灵芝; 张茹; 王兰兰; 侯栋

来源：园艺学报, 2013, (02): 265-274.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2013.02.010

• 辣椒
• EST-SSR
• 分子标记
• 遗传多样性 pepper
• EST-SSR
• molecular marker
• genetic diversity

为开发高效实用的EST-SSRs标记,从120605条辣椒无冗余EST序列中共搜索到10179条至少含有1个SSR的EST序列,占EST总数的8.44%。高频重复类型为一核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,占EST-SSRs总数的91.63%。最常见的基元是A/T,其次是TC/GA和CT/AG。设计合成了20对EST-SSRs引物并对25份辣椒材料进行了PCR扩增,结果表明:17对引物在供试辣椒材料中能扩增出明显的条带,其中12对引物扩增出42条多态性条带,平均多态性条带为3.5条,引物的多态性信息含量介于0.21～0.95之间。利用EST-SSRs标记对供试品种的聚类分析结果与形态学、生物学分类结果...

• 出版日期2013
• 单位甘肃省农业科学院; 甘肃农业大学