基于TCGA数据库分析DDX27在肝细胞癌中的预后价值

作者：朱翠雯; 马甜甜; 段怡平; 陈梁玥; 李东旭; 柳家翠; 喻明霞; 杨桂^*

来源：分子诊断与治疗杂志, 2023, 15(04): 549-553.

DOI：10.19930/j.cnki.jmdt.2023.04.040

• DDX27
• 肝细胞癌
• TCGA数据库
• GSEA
• 信号通路

目的 基于癌症基因图谱(TCGA)数据库，分析DEAD-BOX RNA解旋酶(DDX27)基因在肝细胞癌中的表达、临床意义以及分子信号通路。方法 通过TCGA数据库下载的肝细胞癌相关的表达数据和临床特征数据，运用R.4.0.3软件和Strawberry Perl 5.32.0.1提取肝癌组织和正常组织中DDX27的表达量数据，使用Mann-Whitney U检验比较两组间的表达差异。以DDX27表达量中位值为界将临床资料分为高表达组和低表达组，采用卡方检验分析表达量与临床特征之间的关系。分别进行单因素和多因素cox回归分析，使用Kaplan-Meier法进行生存分析并采用多种在线数据库验证，利用基因富集分析(GSEA)预测DDX27在肝细胞癌中参与的信号通路。结果 肝细胞癌组织中的DDX27表达量显著高于正常组织，差异有统计学意义(P<0.05)，单因素cox回归分析发现DDX27表达与Stage分期(P<0.05)和T分期(P<0.05)有关。多因素cox回归分析得到DDX27(HR=1.07,95%CI:1.02～1.13,P<0.05)可以作为肝细胞癌的独立预后因素。DDX27高表达组的总生存率显著低于低表达组，差异有统计学意义(P<0.05)，与多个在线数据库验证结果一致。GSEA结果表明，高表达的DDX27主要参与RNA降解、细胞周期、嘌呤代谢、同源重组、核苷酸切除修复及胞质DNA传感通路等与癌症发生的分子信号通路。结论 DDX27在肝细胞癌患者中高表达，与肝细胞癌的预后相关，可以作为肝细胞癌预后的新型分子标志物。

• 出版日期2023
• 单位武汉大学中南医院