优良黄皮品种的全基因组Survey分析

作者:刘琪; 李子璇; 夏成材; 肖建加; 江思容; 邹枚伶*; 夏志强*
来源:分子植物育种, 2023, 21(13): 4229-4235.
DOI:10.13271/j.mpb.021.004229

摘要

黄皮是一种富有多种营养价值和药用价值南方小宗水果,本研究挑选优良的三个黄皮品种,分别是鸡心黄皮、无籽黄皮、贵妃黄皮,通过对测序数据的质量控制和组装,完成了三个不同品种黄皮的基因组特征评估,获得了不同品种黄皮基因组特征,这些特征包含基因组大小、杂合度、重复序列以及GC含量信息,同时,通过这些特征对三个品种黄皮基因组进行了初步组装。预估基因组结果表明:(1)三个不同品种预估基因组大小介于252~275 Mb,杂合度介于0.22%~0.58%,GC含量介于33.21%~43.16%;(2)初步组装三个品种黄皮基因组大小在310 Mb左右,N50均超过1 000 bp,通过基因组调查分析为后续相关品种黄皮全基因组测序提供重要理论依据,也为黄皮分子机理研究及黄皮育种提供有用的材料。

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