抗原特异TCR α和β链基因克隆及分子空间结构预测

作者：尹青松; 谭获; 陈少华; 杨力建; 李萡; 叶静梅; 李扬秋

来源：第三军医大学学报, 2011, 33(04): 349-352.

DOI：10.16016/j.1000-5404.2011.04.006

• T细胞受体
• CDR3区
• 同源建模
• 弥漫大B细胞淋巴瘤

目的扩增弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)相关抗原特异T细胞克隆的全长TCRα和β链基因序列,并对其三维空间结构进行预测。方法从已鉴定的2例伴有克隆性增殖TCR Vα6和Vβ13亚家族T细胞的DLBCL患者外周血中克隆全长TCRα和β基因序列,利用Primer Premier 5.0分析软件推算其相应的氨基酸序列,并通过自动化蛋白质模建服务器SWISS-MODEL进行三维空间结构预测。然后利用蛋白质三维图像分析软件Rasmol对所获得的TCR三维空间结构进行显示和分析。结果获得DLBCL相关抗原特异TCRα6和β13全长基因序列及其氨基酸序列。2例患者的TCR Vα6的空间结构与PDB ID:3ffcD模型相似,序列同源性分别为92.16%和91.71%;而2个TCR Vβ13也均具有同一个空间结构模型PDB ID:2ialD,序列同源性分别为92.95%和92.18%。结论来自不同DLBCL患者外周血中克隆性增殖的TCR Vα6或Vβ13亚家族T细胞的TCR具有高度同源性的空间结构,提示其可能识别相同的肿瘤抗原表位。

• 出版日期2011
• 单位广州医学院第一附属医院; 河南省肿瘤医院; 广州医学院/第一附属医院; 暨南大学