驴生长激素基因序列初步分析

作者：陈建兴; 孙玉江; 潘庆杰; 陈海伟; 赵冰; 李冰

来源：湖北农业科学, 2015, 54(07): 1751-1754.

DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2015.07.056

• 驴(Equus asinus)
• 生长激素
• 生物信息分析
• 密码子使用偏好

通过对驴(Equus asinus)GH基因序列进行生物信息学分析,结果表明,驴GH基因共包含5个外显子和4个内含子。5个外显子连接形成651 nt的CDS区序列,整个CDS区翻译出216个氨基酸构成的多肽。驴GH基因编码的216个氨基酸中,大多数氨基酸为亲水性氨基酸。原始肽链的前20多个氨基酸序列出现一个典型的疏水峰,为该原始肽链的信号肽片段。驴的GH基因中的氨基酸以亮氨酸所占的比例最高(13.89%,共出现30次),其次为丙氨酸(10.19%,共出现22次),最低的为色氨酸(0.93%,共出现2次)。驴生长激素的编码存在明显的密码子使用偏好。

• 出版日期2015
• 单位赤峰学院; 生命科学学院; 动物科技学院; 青岛农业大学