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摘要
目的：借助生物信息学技术研究哮喘的基因芯片数据，筛选差异基因，进行富集分析及免疫细胞浸润分析，探讨哮喘的发病机制，进一步探讨哮喘治疗的潜在靶点或生物标志物，并以核心基因映射数据库，为中药治疗哮喘提供理论依据。方法：在GEO数据库中获得哮喘基因表达谱数据集GSE179156，利用GEO2R在线分析工具，筛选显著差异基因，进行可视化处理。对显著差异基因进行富集分析，获得显著基因相关信号通路。对显著差异基因进行蛋白质互作网络分析，筛选核心基因，并进一步筛选哮喘相关信号通路。选用CIBERSORT反卷积法，借助在线平台Sangerbox对基因表达谱数据进行分析，获得可信样本的22种免疫细胞浸润水平。将核心基因与coremine medica数据库映射，获得治疗哮喘的潜在中药。结果：研究获得显著差异基因共220个，其中上调基因128个，下调基因92个，富集分析获得13条信号通路，其中RAS、MAPK信号通路和哮喘密切相关，筛选到17个核心基因。免疫细胞浸润分析发现哮喘患者的γδT细胞、活化树突状细胞比例增加，活化的CD4+T记忆性细胞、M1巨噬细胞在哮喘免疫失衡中发挥协同作用，未活化的肥大细胞、活化的肥大细胞发挥拮抗作用。以核心基因预测到17个治疗哮喘的中药。结论：包括FETUB、BDNF、CD44、KIT、MUC5AC、C3等在内的17个核心基因可能成为为哮喘治疗的潜在靶标或生物标志物，哮喘的发病与17个核心基因、γδT细胞和活化树突状细胞相关，激活RAS、MAPK等信号通路，中药人参、三七、丹参、黄芩、姜黄、穿山龙等可作为治疗哮喘的潜在中药。
- 出版日期2023
- 单位安徽中医药大学第一附属医院; 安徽中医药大学
