铁皮石斛甘露糖结合凝聚素的分子建模与对接研究

作者：朱梦丽; 朱乾坤; 邹嘉欣; 冯沛春; 范高韬; 王万军

来源：生物信息学, 2013, (04): 243-249.

• 甘露糖结合凝集素
• 铁皮石斛
• 同源建模
• 分子对接 Mannose-binding Lectin
• Dendrobium Officinale
• Homology Modeling
• Molecular Docking

本文通过序列分析获得了铁皮石斛甘露糖结合凝聚素(Dendrobium officinale mannose-binding lectin,DOL)成熟肽和甘露糖结合位点(50-58AA,81-89AA,116-124AA)。通过同源建模建立了DOL三维结构模型,DOL呈中空的三棱柱结构,三棱柱的三个侧面主要由β折叠构成,三个侧面各有一个甘露糖结合部位。甘露糖与DOL的分子对接和动力学分析表明,结合位点50-58AA和81-89AA对甘露糖的结合要强于116-124AA,在与甘露糖结合的过程中发挥关键作用的氨基酸残基为Gln81,Asp83,Asn85和Tyr89。研究结果有助于进一步开展凝集素...

• 出版日期2013
• 单位西南交通大学