埃可病毒9型分离株MSH-KM812 VP1基因的遗传特征

作者:潘玥; 戴素萍; 朱艳菊; 李丽; 邓新强; 廖宏玮; 刘雅灵; 马绍辉
来源:中国生物制品学杂志, 2013, (03): 346-348+353.
DOI:10.13200/j.cjb.2013.03.55.pany.006

摘要

目的分析2010年昆明市引起手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原埃可病毒9型(Echovirus 9,E9)分离株MSH-KM812 VP1基因的遗传特征。方法分别采用RD细胞和Hep-2细胞对3份HFMD患儿粪便标本进行病毒分离,应用RT-PCR法分2段扩增病毒VP1基因,并进行序列测定。应用NCBI BLAST软件对所测定的节段序列进行比对;Omiga软件对所测定的节段序列的核苷酸及推导的氨基酸序列进行编辑、比对和拼接;应用Mega 5.05软件进行序列分析,并与15个E9参考株的VP1基因序列进行比较,构建基因系统进化树。结果从3份HFMD患...

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