ERIC序列在不同细菌基因组中分布的分析

作者：曹又方; 赵立平

来源：山西大学学报(自然科学版), 2002, (04): 354-357.

DOI：10.13451/j.cnki.shanxi.univ(nat.sci.).2002.04.021

• ERIC(IRU)
• 重复序列
• HMMER
• 全基因组序列搜索 ERIC(IRU)
• Repetitive DNA Sequence
• HMMER
• complete sequence search

重复 DNA序列是细菌基因组中的一个重要组成部分 ,而 ERIC(IRU )序列是在肠道细菌基因组中发现的一类基因间重复序列。本研究使用 HMMER软件建立 ERIC序列族的模型 ,并用该模型对 4 6个已测序的菌株进行全基因组序列搜索 ,并对搜索结果进行比较分析 ,找出 ERIC(IRU )序列在不同细菌基因组中的分布规律 ,即 ERIC序列主要存在于肠道细菌中 ,并不是在细菌基因组中普遍存在的

• 出版日期2002
• 单位上海交通大学; 山西大学