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摘要
【目的】了解金黄色葡萄球菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats，CRISPR)的分布情况，分析其对抗生素耐药基因和毒力基因水平转移的影响。【方法】从公共数据库获取组装完整的金黄色葡萄球菌基因组575个，利用生物信息学方法，统计CRISPR的携带情况、菌株多位点序列分型（Multilocus sequence typing，MLST）型别分布和菌株耐药基因、毒力基因的的分布情况，对CRISPR结构阳性和CRISPR结构阴性的金葡菌耐药基因和毒力基因携带数目情况进行差异性分析。同时对实验室60株金葡菌二代测序数据进行分析，验证公共数据库分析结果。并对实验室60株金葡菌中原噬菌体、接合质粒的携带情况进行统计，讨论CRISPR结构对菌株原噬菌体和接合质粒的影响。【结果】基因组组装完整的575株金葡菌中，有62株携带CRISPR结构，513株不携带CRISPR结构；含CRISPR结构的金葡球菌携带耐药基因、毒力基因的数目小于不含CRISPR结构的金葡菌，差异具有显著性。实验室60株金葡菌中，有14株携带CRISPR结构，46株不携带CRISPR结构；CRISPR结构阳性的金葡菌携带更少的耐药基因和毒力基因，与公共数据库分析结果一致。对原噬菌体和接合质粒的分析结果显示，CRISPR阴性菌株携带更多的原噬菌体序列，与CRISPR阳性菌株之间有显著性差异。接合质粒方面，CRISPR阴性和CRISPR阳性菌株基本一致，无显著性差异【结论】CRISPR结构可能限制了金黄色葡萄球菌中耐药基因和毒力基因的水平转移，CRISPR结构阴性菌株更容易受到噬菌体和可移动元件的干扰。
- 出版日期2022-6-23
- 单位华南农业大学
