电喷雾质谱法研究天然产物小分子识别人类端粒G-四链体及复合物的热稳定性

作者：何湘伟; 龙海涛; 袁谷; 徐筱杰; 周亚伟

来源：Acta Physico - Chimica Sinica, 2010, (04): 1082-1086.

• 分子模拟
• 端粒
• G-四链体DNA
• 天然产物小分子
• 电喷雾质谱 Molecular modeling
• Telomere
• G-quadruplex DNA
• Natural product molecule
• Electrospray ionization mass spectrometry

利用电喷雾质谱(ESI-MS)研究了12种天然产物小分子与人类端粒G-四链体结构的非共价相互作用和识别功能,比较了不同小分子与人类端粒G-四链体的结合强弱,发现了一种新的识别小分子——防己诺林碱对人类端粒G-四链体有很好的结合.通过质谱升温实验比较了小分子结合对G-四链体热稳定性的影响,防己诺林碱的结合使G-四链体的离子的解离温度(T1/2)上升到200℃.利用分子模拟对G-四链体DNA与小分子结合的模式以及稳定性进行了探讨,给出了防己诺林碱可能的结合位点和结合模式,Autodock计算出来的结合能约为-31.5kJ·mol-1.同原来的平面型分子不同,防己诺林碱是一类新型结构的分子,为设计合...

• 出版日期2010
• 单位北京大学