豆科植物查尔酮合成酶基因密码子偏好性分析

作者：张家琪; 徐悦; 李晓冰; 李思远; 尹哲宁; 周嘉裕; 廖海

来源：华北农学报, 2016, (06): 12-20.

• 豆科植物
• 查尔酮合成酶
• 密码子偏好性
• 聚类分析 Leguminosae
• Chalcone synthase
• Codon bias
• Phylogenic analysis

查尔酮合成酶(Chalcone synthase,CHS)是参与合成植物苯丙烷类物质的主要酶类之一。研究豆科植物CHS基因密码子的偏好性,对提高豆科植物CHS基因的表达水平具有重要意义。为此,运用CHIPS、CUSP和Codon W程序分析豆科植物CHS基因密码子的偏好性,并用决明CHS基因对分析结果的可信度进行验证。结果表明,在豆科植物CHS基因的密码子中,以A或U结尾的密码子偏好性较强。基于CHS基因RSCU值的聚类结果显示,豆科植物与茄科植物(包括烟草)聚为一类,表明烟草作为研究豆科植物CHS基因功能的模式植物较为合适。通过对决明CHS基因密码子偏好性与大肠杆菌和酵母基因组密码子偏好性的...

• 出版日期2016
• 单位西南交通大学