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摘要
目的 建立一套基于多重PCR-连接酶检测反应（ligase detection reaction,LDR）技术的近交系大鼠单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNP）检测方案。方法 在5个品系的SPF级近交系大鼠1～20号常染色体和X染色体上共选取40个大鼠SNP位点，将SNP位点随机分为4组，构建基于多重PCR-LDR技术的近交系大鼠4组SNP位点基因检测方案。采用本方案检测国内另两家大鼠供应商的9个常用大鼠品系。最后，通过第三方实验室对不同DNA聚合酶的扩增效果进行比对，验证本方案的可行性。结果 用所构建的近交系大鼠SNP遗传检测方案测试5个大鼠品系时，各样本的所有位点均得到了良好的扩增结果。采用本方案检测国内另两家大鼠供应商的9个常用大鼠品系时也得到了良好的扩增结果，40个SNP位点在每个近交系大鼠中均为纯合。用3种来源不同的DNA聚合酶同时检测相同大鼠DNA样本的结果显示，Multiplex PCR Kit、AmpliTaq Gold?360 DNA聚合酶、Platinum Ⅱ Taq热启动DNA聚合酶在第1～3组SNP位点均有扩增产物的电泳峰，其中Platinum Ⅱ Taq热启动DNA聚合酶在第4组SNP位点中少了一个扩增产物的电泳峰。另外，不同实验室间的比对结果显示，相同扩增体系的检测结果一致。结论 基于多重PCR-LDR技术成功建立了一套覆盖所有常染色体与X染色体的大鼠SNP检测方案，该方法的稳定性和重复性俱佳。
- 出版日期2023
- 单位中国人民解放军空军军医大学; 上海实验动物研究中心; 陕西省中医药研究院
