摘要
青檀是耐干旱瘠薄的石灰岩山地造林先锋树种,其韧皮纤维制作“宣纸”的原材料。本文采用PLEK、CNCI、CPC2、Pfam四个生物信息学软件对青檀(Pteroceltis tatarinowii)氮素响应全长转录组得到的11 801条基因序列进行蛋白编码潜能预测分析,分别获得5 077、3 299、2 202、2 878个长链非编码RNA(long non-coding RNA),通过制作韦恩图取四组数据的交集,最终获得1 161个lncRNA,最短的为200 nt,最长的为4 122 nt,大部分lncRNA长度在200~1000 nt区间,占总数的58.51%。本研究结果为深入开展青檀氮素响应分子机制的研究提供了参考。
- 出版日期2021-9-9
- 单位泰安市泰山林业科学研究院; 泰山学院; 菏泽学院; 生物工程学院