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摘要
目的 研究青黄散治疗骨髓增生异常综合征(Myelodysplasticsyndrome, MDS)的潜在分子靶点及作用机制。方法 研究纳入15例MDS患者，在治疗前以及青黄散治疗6个月后提取骨髓样本，以转录组测序检测治疗前后骨髓单个核细胞基因的差异表达，并通过基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析对差异表达基因进行功能富集分析。利用Cytoscape 3.9.1软件构建差异表达基因蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI);为了验证体内结果，选取MDS细胞株MUTZ-1作为实验对象作体外实验，以青黄散主要有效成分硫化砷为干预手段，使用实时定量PCR验证测序结果。结果 转录组分析证实，与治疗前比较，经青黄散治疗6个月后MDS患者骨髓有核细胞有2841个差异表达基因，包括1892上调基因和949个下调基因，GO功能富集分析发现这些差异表达基因参与了组蛋白修饰这一与MDS高度相关的生物过程。KEGG分析发现，HIF-1、TNF-α及VEGF等信号通路可能是青黄散治疗MDS的潜在通路。根据GO富集分析结果，组蛋白修饰差异表达基因被用于构建PPI蛋白互作网络并进行核心基因的筛选，进一步体外验证实验发现，硫化砷干预MDS细胞株后EP300、HDAC7与SETD2较对照组显著上调，HDAC6显著下调，与测序结果一致。结论 组蛋白修饰是青黄散治疗MDS的重要作用机理，可能涉及EP300、HDAC6、HDAC7与SETD2等分子靶点。
- 出版日期2023
- 单位中国中医科学院西苑医院
