坛紫菜(Pyropia haitanensis)核糖体基因簇序列的测定

作者:张皓; 何渊; 沈颂东
来源:常熟理工学院学报, 2015, 29(04): 15-24.
DOI:10.16101/j.cnki.cn32-1749/z.2015.04.003

摘要

坛紫菜是我国独有的栽培紫菜物种,而目前对坛紫菜分类学层面上仍缺乏有效的分子鉴定技术.本研究通过PCR方法,对采自福建省莆田海区坛紫菜样品核糖体基因簇序列进行了测定,目的是为坛紫菜分类及种质鉴定提供分子生物学证据.测定结果表明,坛紫菜样品的18Sr DNA的全长序列长度为2953 bp;28S r DNA部分序列3603 bp,且不含内含子;5.8S r DNA长度为158 bp,该区域的5’端和3’端十分保守,在紫菜属中差异较小;ITS1的长度为334 bp;ITS2为678bp.已经测定IGS区的部分长度为3555 bp,该区域存在复杂二级结构.通过对坛紫菜核糖体基因簇序列的分析表明,其能够成为紫菜分类鉴定与系统演化的分子标记.

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