青岛文昌鱼过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析

作者：于德玲; 王昌留^*; 袁牧; 段菁菁; 胡岳

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(02): 514-523.

DOI：10.13417/j.gab.039.000514

• 过氧化氢酶
• 基因克隆
• 序列分析
• 青岛文昌鱼

过氧化氢酶(catalase, CAT)是一类广泛存在于动物、植物和微生物体内的末端氧化酶,是生物体内抗氧化酶体系的重要成员,因此本研究旨在克隆文昌鱼CAT基因并对其进行生物信息学分析。本研究以青岛文昌鱼(Branchiostoma belcheri tsingtauense)为材料,用RACE技术首次克隆了其CAT全长cDNA的基因序列,命名为AmphiCAT (GenBank登录号:KU058636);该序列总长为2 640 bp,开放阅读框(open reading frame, ORF)为1 533 bp,编码510个氨基酸,含有一个长为19个氨基酸序列的潜在活性位点和一个长为9个氨基酸序列的血红素配体信号,总分子量在线预测约为57.85 kD;经生物软件分析确定该蛋白质无信号肽序列,预测该蛋白质为非分泌性蛋白,属于单功能CAT的clade3分支;该基因的分子进化树表明青岛文昌鱼CAT同软体动物的亲缘关系较近。

• 出版日期2020
• 单位生命科学学院; 鲁东大学