RhD抗体ssDNA适配体结构分析

作者:张印则; 吴凡; 苏宇清; 梁延连; 庄乃保; 徐华; 周华友
来源:中国输血杂志, 2015, 28(07): 765-768.
DOI:10.13303/j.cjbt.issn.1004-549x.2015.07.006

摘要

目的预测RhD抗体核酸适配体序列库中优势适配体,为实验室验证做准备。方法对以RhD抗体为目标靶分子而筛选出的适配体序列库做克隆测序;使用ClustalⅩ软件对阳性克隆子序列做同源性分析;使用DNA folding form在线分析工具对阳性克隆子碱基序列做最小自由能及二级结构分析。结果 RhD抗体28个阳性克隆子碱基序列按照基序的不同可分为3个家族,家族1和2中的适配体又可分为不同的亚家族;可形成由2-4个多分支环组成的二级结构,最小自由能在(-7.47--5.09)kcal/mol。结论 RhD家族1中的亚家族3和4适配体二级结构较为稳定,最小自由能较低,是RhD抗体适配体库中的优势适配体。

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