火炬松生长和松脂性状相关候选基因的单核苷酸多样性分析

作者：杨会肖; 刘天颐; 徐斌; 刘纯鑫; 王金榜; 黄少伟

来源：华南农业大学学报, 2015, (01): 75-81.

• 火炬松
• 候选基因
• 单核苷酸多态性
• 连锁不平衡 loblolly pine
• candidate gene
• single nucleotide polymorphism(SNP)
• linkage disequilibrium(LD)

【目的】对火炬松Pinus taeda生长和松脂产量相关功能基因单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行筛选与分析,为分子标记辅助育种提供技术基础。【方法】利用生物信息学对火炬松c DNA文库进行整理、比对、剪接、注释,挑选出与生长素、赤霉素、细胞分裂素及蒎烯合成相关的非重复序列基因(Unigene)作为候选基因片段,利用MEGA5.0和Dna SP4.0软件对火炬松36个单株的8个候选基因片段进行序列比对和分析。【结果】所测序列总长为5 177 bp,检测到184个SNP位点,平均36.9 bp的基因序列中出现1个SNP位点,其中123个...

• 出版日期2015-12-7
• 单位广东省林业科学研究院; 华南农业大学