杜仲果实和叶片转录组数据组装及基因功能注释

作者：李铁柱; 杜红岩; 刘慧敏; 乌云塔娜; 王淋; 叶生晶

来源：中南林业科技大学学报, 2012, (11): 122-130.

DOI：10.14067/j.cnki.1673-923x.2012.11.023

• 杜仲
• 果实
• 叶片
• 转录组
• 基因功能 Eucommia ulmoides
• fruits
• leaves
• transcriptome
• Gene Ontology

所构建的杜仲果实和叶片转录组数据库获得了54 471 338条reads数据,包含4 902 420 420nt数据信息,对reads进行拼接,获得了452 421条Contig,总长度为90 705 736 nt;对contig进行拼接后,获得了147 027条Scaffold,总长度为65 877 052 nt;同理,对Scaffold进一步拼接后,获得了49 610条Unigene,总长度为37616 729 nt;Unigene和COG数据库进行比对表明,杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据功能大致可分为25类;杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据GO功能可分为生物过程、细...

• 出版日期2012
• 单位中国林业科学研究院; 中南林业科技大学