短命植物新疆小拟南芥高盐胁迫处理下内参基因的筛选

作者：金玉环; 刘芳; 黄薇; 孙琦; 黄先忠^*

来源：玉林师范学院学报, 2018, 39(02): 2-9.

DOI：10.13792/j.cnki.cn45-1300/z.2018.02.002

• 小拟南芥
• 实时荧光定量PCR
• NaCl胁迫
• 内参基因

新疆小拟南芥(Arabidopsis pumila)是早春短命植物,广泛分布于新疆极端环境,是研究生物和环境适应机制较好的模式材料.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是一种常用的可以快速获取基因表达的分析方法,而选择合适的内参基因是实时荧光定量PCR的前提.本研究从小拟南芥全长转录组数据库中选取了14个候选内参基因,利用qRT-PCR分析内参基因在250 mmol/L NaCl胁迫处理0、3、6、12、24和48 h共6个不同时间点样品中的基因表达,利用geNorm、Norm Finder和Bestkeeper三种软件进行数据分析.结果显示:在250 mmol/L NaCl胁迫处理下,较为稳定表达的内参基因是GAPDH和ACT1.本研究筛选出高盐胁迫处理下的稳定表达的GAPDH和ACT1基因作为内参基因,对后续验证基因的表达和揭示小拟南芥耐逆机制具有重要意义.

• 出版日期2018
• 单位石河子大学; 生命科学学院