一个辣椒轻斑驳病毒中国分离物的基因组测序及分析

作者：李丽丽; 郑敏; 杨洪一^*

来源：中国瓜菜, 2020, 33(06): 12-16.

DOI：10.16861/j.cnki.zggc.2020.0130

• 辣椒
• 辣椒轻斑驳病毒
• 基因组

利用CTAB法分离辣椒叶片总RNA,利用RT-PCR技术扩增出了辣椒轻斑驳病毒中国分离物Hrb基因组不同区域片段。并经克隆、测序,证明其为辣椒轻斑驳病毒特异序列。经序列拼接,获得了6 290 nt的辣椒轻斑驳病毒中国分离物Hrb基因组全序列;该序列与GenBank中已报道的其他辣椒轻斑驳病毒基因组的序列同源性为94.0%～99.6%。系统进化分析显示辣椒轻斑驳病毒中国分离物Hrb与日本分离物(PMMoV-J、C-1421、Pa18、TPO-2-19)亲缘关系较近,与西班牙分离物Ia亲缘关系较远。

• 出版日期2020
• 单位黑龙江省林业科学研究所; 东北林业大学; 生命科学学院