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摘要
青花菜（Brassica oleracea L.var. italica）为十字花科芸薹属甘蓝种作物，具有较高的经济和营养价值。本试验对青花菜自交系进行全长转录组测序，获得非冗余转录本24 365条，预测出20 399个完整CDS区，检索到17 116个SSR位点，多数SSR属单核苷酸类型（45%）。非冗余转录本注释结果表明有24 173个（99.21%）转录本被成功注释。NR数据库中注释为甘蓝型油菜（Brassica napus）的相关基因数最多（70.63%），其次为白菜型油菜（Brassica rapa） （25.07%）。GO数据库中有22 584个（92.69%）转录本被成功注释，可分为细胞组成、分子功能、生物过程3大类。COG数据库中有10 880个（44.65%）转录本得到注释，分为25大类。KEGG代谢途径分析中，有10 439个（42.84%）转录本被注释，分布在126条代谢通路中。本研究结果可丰富及深化青花菜转录组信息，也为重要农艺性状定位、生长发育调控机理、抗性机制等方面的研究提供重要的数据支持。
- 出版日期2021-7-21
- 单位生命科学学院; 昆明学院; 温州科技职业学院
