肠球菌CRISPR-Cas系统基因结构的分析及其与耐药基因的关系

作者：兰蕾; 郑旭; 迟媛媛; 王雪婷; 王梦园; 朱元祺; 闫志勇^*

来源：微生物学杂志, 2022, 42(02): 58-64.

• 肠球菌属
• 基因结构
• CRISPR-Cas系统
• 耐药基因
• 免疫防御

CRISPR-Cas系统是一种细菌的适应性免疫系统，参与特异性防御不同类型的可移动遗传元件，如质粒、噬菌体、转座子等的入侵。旨在分析肠球菌(Enterococcus)基因组中该系统的基因结构，并探讨其与细菌耐药基因之间的关系。NCBI数据库中下载10种肠球菌的全基因组信息，利用软件对CRISPR-Cas系统的分布、cas1基因、重复序列、间隔序列等进行比对分析；查找耐药相关基因，分析其与CRISPR-Cas系统之间的关系。235株肠球菌中含完整CRISPR-cas系统的有35株(14.9%),含确定CRISPR阵列196个和cas基因簇46个。肠球菌基因组中CRISPR系统主要为II-A型(80.4%),其次是II-C型(15.2%),cas1基因序列的系统发育分析结果与CRISPR-cas系统的分型基本一致。肠球菌CRISPR-Cas系统的分布在不同菌种之间差异较大；CRISPR-Cas系统可能阻碍肠球菌某些耐药基因的水平转移。

• 出版日期2022
• 单位青岛大学; 青岛大学附属医院; 青岛市市立医院