绵羊肺腺瘤病毒NM株囊膜蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位预测

作者：刘月; 张宇飞; 张亚坤; 孙晓林; 刘淑英

来源：动物医学进展, 2013, (01): 29-33.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2013.01.003

• 绵羊肺腺瘤病毒
• 囊膜蛋白
• B细胞表位
• 二级结构 OPAV
• envelope protein
• B cell epitope
• secondary structure

利用生物信息学预测绵羊肺腺瘤病毒(OPAV)NM株囊膜蛋白优势抗原表位,为寻找用于绵羊肺腺瘤病诊断和预防的候选抗原表位提供参考。参照OPAV-NM株env基因序列(登录号:JQ837489),应用Gamier-Robson方法、SOPMA方法和网络服务器PSIPRED、Predictprotein预测OPAV-NM株囊膜蛋白的二级结构。用Kyte-Doolittle方法预测蛋白质的疏水区和亲水区,用Emini方法预测蛋白质表面可能性,以Jamson-Wolf方法预测蛋白的抗原指数,利用Bcepred、IEDB、ABCpred网络服务器预测囊膜蛋白的抗原性,然后综合评价囊膜蛋白的B细胞抗原表位。...

• 出版日期2013
• 单位内蒙古农业大学