杉木SSR-PCR体系优化

作者：徐阳; 陈金慧; 王颖; 赵亚琦; 王新民; 郑仁华; 施季森

来源：林业科技开发, 2014, (01): 15-20.

DOI：10.13360/j.issn.1000-8101.2014.01.004

• 杉木
• 分子标记
• SSR-PCR
• 正交试验
• 体系优化 Chinese fir
• molecular marker
• SSR-PCR
• orthogonal experiment
• PCR system optimization

SSR-PCR反应体系优化是杉木SSR标记研究的基础。利用正交L16(45)设计实验对杉木SSR-PCR反应体系的Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和DNA浓度5个因素的4个水平进行优化试验。并在正交直观分析和方差分析的基础上,分别对Mg2+、dNTPs进行单因素确定。获得的最佳反应体系为:在20μL反应体系中,Mg2+浓度为1.0mmol/L,引物浓度为0.25μmol/L,dNTPs浓度为0.15 mmol/L,Taq酶为0.05 U/μL,DNA为30 ng,10×PCR Buffer2μL,不足部分用双蒸水补齐至20μL。在最佳反应体系的基础上,采用单因素实验确定了引物的最佳退火范围...

• 出版日期2014
• 单位南京林业大学; 福建省林业科学研究院