酿酒酵母核小体定位理论模型的体外实验验证

作者：王成爱; 赵宏宇; 邢永强; 邵灵利; 蔡禄

来源：生命科学研究, 2014, (01): 21-27.

DOI：10.16605/j.cnki.1007-7847.2014.01.003

• 酿酒酵母
• 核小体定位
• 位置权重矩阵
• 盐透析法
• 体外实验 Saccharomyces cerevisiae
• nucleosome positioning
• position weight matrix
• salt dialysis method
• in vitro experiment

核小体定位对真核生物基因表达调控发挥着重要作用。前期基于核小体核心及连接区域的k-mer频次分布偏好性,构建了位置权重矩阵算法,并在酿酒酵母基因组内较好地预测了核小体占据率。利用该理论模型,以1 bp碱基为步长、147 bp碱基为窗口,用该算法计算了酵母1号、3号、14号染色体上核小体形成能力强、中、弱各3条长度为147 bp的DNA序列,将这些片段克隆到重组质粒中,大量扩增回收9条标记biotin分子的目的序列。同时分别表达纯化了组蛋白H2A、H2B、H3和H4,复性后装配形成组蛋白八聚体结构。利用盐透析方法将9条DNA序列在体外组装形成核小体结构,经biotin标记检测后计算了反应过程的吉...

• 出版日期2014
• 单位内蒙古科技大学