雷公藤牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶基因全长cDNA的获得及生物信息学分析

作者：张萌; 苏平; 刘雨佳; 童宇茹; 赵瑜君; 高伟; 王秀娟; 黄璐琦

来源：中国中药杂志, 2015, 40(06): 1066-1070.

• 雷公藤
• 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶
• 克隆
• 生物信息学分析

该研究利用c DNA末端快速扩增(RACE)技术从雷公藤悬浮细胞中克隆得到一条GGPPS全长c DNA(Gene Bank:KM978333),并对其进行多重序列比对、蛋白结构预测及构建系统进化树等生物信息学分析。所克隆的Tw GGPPS c DNA全长1 857 bp,编码含514个氨基酸的蛋白序列,相对分子质量为57.13 k Da,等电点为7.85,具有5个保守域和2个功能域,亚细胞定位预测显示其可能位于质膜上,多重序列比对及系统进化树结果显示与其他植物GGPPS家族具有较高同源性。实验首次克隆了雷公藤GGPPS基因,为进一步研究雷公藤甲素等二萜化合物生物合成途径奠定基础。

• 出版日期2015
• 单位首都医科大学; 中国中医科学院; 医药学院