基于生物信息学分析TGFBI基因在头颈部鳞癌中的表达及其预后意义

作者：胡婷; 卢诗丽; 李钰颖; 刘洁兰; 侯沅林; 莫丽梅; 唐玉莲^*

来源：右江医学, 2023, 51(02): 102-108.

• 转化生长因子β诱导基因
• 头颈部鳞癌
• 生物信息学
• 预后

目的 探讨转化生长因子β诱导基因(transforming growth factor β-induced gene, TGFBI)在头颈部鳞癌(head and neck squamous carcinoma, HNSC)中的表达及其预后意义。方法 首先通过TIMER2.0数据库分析TGFBI基因在泛癌中的表达水平；并进一步利用UALCAN数据库和GEPIA数据库检索TGFBI基因在HNSC与正常组织中的表达水平，以及TGFBI基因与患者种族、年龄、性别、肿瘤分期、淋巴结转移状况等相关临床特征的关系；通过STRING数据库分析TGFBI基因的互作蛋白，借助DAVID数据库对其与互作蛋白基因进行功能富集分析；最后通过GEPIA数据库分析TGFBI基因在HNSC中的生存意义。结果 发现TGFBI在HNSC中的表达明显高于正常组织(P<0.05),TGFBI高表达的患者总生存期明显低于低表达的患者(P<0.05)。蛋白互作分析发现，FN1、MMP14、ITGA3、ITGAM、ITGAV、ITGB1、ITGB2、ITGB3、TGIF2和TGIF2LX这10个蛋白基因与TGFBI存在紧密联系，此外，TGFBI及相关基因功能富集分析显示它们主要参与了5个生物学程序、4个细胞组分、3个分子功能、4个信号通路。结论 TGFBI在HNSC中的表达水平较正常组织明显升高，且与患者预后不良有关，有望成为HNSC诊断和治疗的生物学靶点。

• 出版日期2023
• 单位右江民族医学院