坛紫菜磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的克隆与序列分析

作者：张晓娟; 王广策; 何林文; 陈昌生

来源：海洋科学, 2011, (04): 70-76.

• 坛紫菜
• PEPC基因
• 序列分析
• 系统进化分析 Porphyra haitanensis
• phosphoenolpyruvate carboxylase gene
• sequence analysis
• phylogenetic tree analysis

采用同源克隆的方法和RACE技术,从坛紫菜cDNA中获得了磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)的序列,该段序列含2538个核苷酸包含一个终止密码子TAG和191 bp的3′端非编码区(UTR),可编码846个氨基酸。该段序列中无跨膜结构和信号肽序列,推导的氨基酸序列中C末端第813位氨基酸是丙氨酸(A),表明是一个C3型基因。相似性分析表明,坛紫菜PEPC与其他物种有很高的一致性,约为35%～50%。结构分析显示,该序列具有两个PEPC基因保守活性位点和5种模式的其他功能位点。进化分析显示,坛紫菜PEPC羧化酶氨基酸序列更接近于C3型,进化上更为古老。该实验对进一步深入研究坛紫菜PEPC羧化酶功...

• 出版日期2011
• 单位中国科学院大学; 集美大学; 天津科技大学; 中国科学院海洋研究所