叶酸代谢通路基因在肝癌中的表达及意义

作者：孙文文; 张凌云^*

来源：肝脏, 2021, 26(08): 851-856.

DOI：10.14000/j.cnki.issn.1008-1704.2021.08.008

• 肝癌
• 叶酸代谢通路
• 预后
• 免疫
• 生物信息学

目的通过生物信息学分析叶酸代谢关键基因在肝癌中的表达、预后价值及与免疫微环境的相关性。方法利用Oncomine、GEPIA分析叶酸代谢关键基因在肝癌中的表达,采用cBioPortal分析肝癌患者中叶酸代谢关键基因的改变情况,Kaplan-Meier生存曲线分析与肝癌患者预后的关系,采用STRING、GeneMANIA构建叶酸代谢关键基因的互作网络,并通过TIMER数据库分析这些基因与免疫浸润细胞的相关性。结果通过Oncomine、GEPIA数据库发现在肝癌组织中MTR和MTHFD2的mRNA表达量分别是正常组织的2倍和1.6倍(P<0.05)。cBioPortal分析显示肝癌中叶酸代谢关键基因的改变,主要包括基因扩增、缺失突变和错义突变。Kaplan-Meier生存分析显示,MTHFR的高表达与肝癌患者预后差相关(HR=1.49,P=0.04);MTHFD1和SHMT1的高表达与肝癌患者预后良好相关(HR=0.63,P=0.0089和HR=0.52,,P=0.000 31)。TIMER数据库分析显示MTHFR和MTHFD2与B细胞、CD8+T淋巴细胞、CD4+T淋巴细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞的浸润均呈正相关。结论叶酸代谢通路关键基因与肝癌患者预后、免疫细胞浸润存在显著相关性,是潜在的肝癌预后和治疗的靶点。

• 出版日期2021
• 单位上海市第一妇婴保健院; 复旦大学附属中山医院