牛乳头瘤病毒基因2型贵州GZ01流行株全基因组序列测定及其特征分析

作者：张海; 张军; 杨忠成; 廖梅; 周碧君; 王开功; 文明; 程振涛; 王伟; 王铭; 胡兴义

来源：基因组学与应用生物学, 2017, 36(12): 5090-5098.

DOI：10.13417/j.gab.036.005090

• 牛乳头瘤病毒基因2型
• 全基因组序列
• 序列分析

为从分子水平了解牛乳头瘤病毒（bovine papillomavirus,BPV）贵州镇宁GZ01流行株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况,本研究选取贵州镇宁患病牛皮肤肿瘤样物,以乳头瘤病毒L1基因的简并引物MY11/MY09进行PCR扩增,测序后并确定其基因型。根据Gen Bank中BPV参考株设计6对特异性引物,经扩增、测序和拼接后获得BPV流行株全基因组序列。结果序列分析表明,GZ01流行株全基因组长为7 944 bp,具有BPV2基因型的结构特征,与Gen Bank收录的牛乳头状瘤病毒2型基因型参考株BPV2、BPV2-SW01和BPV2-AKS01的核苷酸同源性高达98.8%、99.7%和99.4%,同时与BPV13、BPV1和BPV14的基因型参考株进化关系也比较最近,同属Dalte属。因此,贵州镇宁GZ01株为BPV2基因型,GZ01株为贵州地区首次检测确认并测定了全基因组序列的牛乳头瘤病毒。本研究为贵州地区的牛乳头状瘤的病原鉴定、流行规律、遗传变异以及科学的防控提供了理论依据。

• 出版日期2017
• 单位贵州大学; 动物科学学院