海洋细菌Pseudoalteromonas sp.NJ631中NRPS基因簇及核心模件的发掘

作者：陈威; 朱鹏; 何山; 金海晓; 严小军

来源：微生物学报, 2012, (12): 1531-1539.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.2012.12.013

• 海洋细菌
• 非核糖体肽合成酶
• 腺苷酰化结构域
• 基因组信息发掘 marine bacterium
• nonribosomal peptides synthetases
• adenylation domain
• genome mining

【目的】运用基因组信息发掘技术(Genome Mining)对海洋细菌Pseudoalteromonas sp.NJ631基因组中的非核糖体肽合成酶(Nonribosomal peptides synthetases,NRPSs)基因簇资源及其核心模件进行发掘分析,旨在为Pseudoalteromonas属中非核糖体肽(Nonribosomal peptides,NRPs)的发现提供理论依据和数据支持。【方法】依托第二代测序技术获得的Pseudoalteromonas sp.NJ631基因组序列草图,在分析其次生代谢产物编码基因的基础上,利用NRPS-PKS knowledgebase在线预测...

• 出版日期2012
• 单位宁波大学