甘蔗花叶病毒福州分离物全基因组克隆及种群分析

作者：邓宇晴; 杨永庆; 翟玉山; 程光远; 彭磊; 郑艳茹; 林彦铨; 徐景升

来源：植物病理学报, 2016, (06): 775-782.

DOI：10.13926/j.cnki.apps.2016.06.007

• 甘蔗
• 甘蔗花叶病毒
• 全基因组
• 进化分析 sugarcane
• Sugarcane mosaic virus
• complete genome
• phylogenetic analysis

为丰富甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)种群信息,探索SCMV种群结构,本研究运用RT-PCR方法克隆了采自福州的2个SCMV分离物(分别命名为FZ-C1和FZ-C2)的全基因组,结合已公布的18个SCMV分离物的全基因组序列,利用MEGA 4.1和Simplot软件对SCMV的种群结构进行了分析。结果显示,FZ-C1和FZ-C2全长分别为9 570nt和9 573 nt,均包含一个9 189 nt的开放阅读框,编码长度为3 063个氨基酸的多聚蛋白。这2个分离物与SCM V-A株系的相似性最高,酶切位点也与SCMV-A株系的基本一致。系统发育进化分析表明,...

• 出版日期2016
• 单位福建农林大学