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摘要
预测与分析HP-PRRSV BJBLZ株序列特点,为进一步该毒株的研究做准备。利用分子生物学软件及服务器,对HP-PRRSV BJBLZ株全序列及各结构蛋白的生化特性、溶解性和核定位信号等进行了分析,结果显示HP-PRRSV BJBLZ株至少可划分12个非结构蛋白和6个结构蛋白;同源性比较显示GP3和GP5蛋白变异性高,M和N蛋白保守。GP3、GP5和M蛋白糖基化位点与参考株有变化,GP2、GP4和N蛋白糖基化位点与所有参考株一致。服务器预测显示,N蛋白的碱性氨基酸比例明显高于其他蛋白,总平均亲水值明显低于其他蛋白;GP2、GP3和GP4蛋白不稳定,GP5、M和N蛋白稳定。6个结构蛋白预测不溶性概率均占66%以上,GP3不溶性概率最高。可以利用以上一些不同于以往各代表株的特点,为PRRS的诊断和防治进行进一步的研究。
