新一代测序技术及其对水稻分子设计育种的影响

作者：周德贵; 赵琼一; 付崇允; 李宏; 蔡学飞; 罗达; 周少川

来源：分子植物育种, 2008, 6(04): 619-630.

DOI：10.3969/j.issn.1672-416X.2008.04.001

• 水稻
• 新一代测序
• 分子设计育种 Rice
• Next generation sequencing
• Molecular design breeding

本文概述了以边合成(或连接)边测序为特征的新一代测序技术的基本原理以及现有的Roche(454)GSFLXsequencer、Illumina genome analyzer(Solexa)、Applied Biosystems SOLiDsequencer、HeliScope Sequencer等4种新一代测序平台的发展历史、测序流程、优缺点和测序成本等,并展望了新技术的发展可能对以水稻为代表的农作物大规模分子设计育种产生的影响。本文还提出通过对水稻核心种质育种材料体系的全基因组测序,开发功能性分子标记和特异基因芯片,缩短将基础研究成果应用于实际育种生产的时间,为真正进入分子设计育种时代奠定基础。

• 出版日期2008
• 单位广东省农业科学院水稻研究所; 上海生命科学研究院植物生理生态研究所