代谢网络结构与功能的复杂网络分析

作者：丁德武; 黄海生; 陆克中; 何小青; 计博婧

来源：计算机与应用化学, 2011, (03): 377-380.

DOI：10.16866/j.com.app.chem2011.03.030

• 代谢网络
• 复杂网络
• 社团结构
• 中心化 metabolic network
• complex network
• community structure
• centralization

细胞的新陈代谢过程可以抽象地描述成交互的复杂网络,越来越多的证据表明这种描述和分析有助于理解代谢网络的结构和功能。本文首先对高质量金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)代谢网络数据进行整理,构建了该网络中的所有代谢反应列表。随后用代谢物图(即节点表示代谢物,连线表示代谢反应)来表示这些反应,形成的网络包含了855个节点和1353条连线。最后用复杂网络理论分析了该网络的全局结构特征、巨强连通体的功能模块和关键节点等,并深入分析了网络的蝴蝶结结构,得到的功能模块以及关键节点的生物学功能意义。

• 出版日期2011
• 单位池州学院