青海高原牦牛mtDNACytb基因和D-loop区遗传多样性及系统进化分析

作者：王兴东; 郭宪; 吴晓云; 马启财; 张振宇; 叶娜; 阎萍; 潘和平^*

来源：基因组学与应用生物学, 2021, 40(01): 9-17.

DOI：10.13417/j.gab.040.000009

• 青海高原牦牛
• Cytb
• D-loop
• 遗传多样性
• 系统进化

为探究青海高原牦牛的遗传多样性和起源进化关系,本研究通过测定和分析青海高原牦牛155个个体细胞色素b基因(Cytb)和D-loop区全序列,分析多态性及构建系统进化树。结果表明:青海高原牦牛Cytb基因全序列长度为1 140 bp,个体间序列长度无差异,4种核苷酸T、A、G、C的含量分别为26.26%、31.73%、13.09%、28.920%;发现13个SNP位点,全部为转换,符合Cytb基因保守的特征;核苷酸多样性(Pi)为0.002 88,单倍型数(H)为9,单倍型多样性(Hd)为0.645;D-loop区序列长度在892～895 bp之间,不同个体间存在序列长度差异;4种核苷酸T、A、G、C的平均比例分别为28.69%、32.22%、13.75%、25.34%,A+T含量为60.91%,G+C含量为39.09%。在155个个体中共统计出41个SNP位点,其中转换38个,颠换3个,缺失5个,插入3个。其核苷酸多样性(Pi)为0.012 44,分析得到的单倍型数(H)为38,单倍型多样性(Hd)为0.881。在基于Cytb基因的系统进化树中,青海高原牦牛首先与野牦牛和巴州牦牛聚在一起,紧接着与美洲野牛聚在一起;在D-loop区的系统进化分析中,青海高原牦牛首先与西藏牦牛和野牦牛聚在一起,展示出丰富的遗传多样性,同时进一步支持了牦牛和野牦牛划为牛亚科牦牛属(Bovidae)的观点。本研究结果为牦牛改良及育种工作提供了科学依据。

• 出版日期2021
• 单位西北民族大学; 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所