从金凤蝶分离的一株微孢子虫的全基因组MITEs转座子鉴定与系统进化分析

作者：刘铁; 许金山; 李田; 潘国庆; 何强; 李学燕; 周泽扬

来源：蚕业科学, 2014, (01): 52-58.

DOI：10.13441/j.cnki.cykx.2014.01.001

• 微孢子虫
• 金凤蝶分离株
• 家蚕微孢子虫
• 微型反向重复转座元件
• 基因组 Microsporidia
• Isolate from Papilio machaon Linnaeus
• Nosema bombycis
• Miniature inverted repeat transposable element
• Genome

微型反向重复转座元件(MITEs)是一种非自主性DNA类转座子。从四川省雅安市野外的金凤蝶(Papilio machaon Linnaeus)中分离到一株微孢子虫,简称PM-1。采用生物信息学分析方法,利用MITE-Hunter软件在PM-1基因组中鉴定出21个MITEs家族,命名为NpmME1~NpmME21。其中有5个家族属于Stowaway-like类,1个家族属于Tourist-like类,2个家族属于Pegasus-like类,其余13个家族为新家族。比较家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)已鉴定的MITEs转座子,发现PM-1分离株的NpmME20与家蚕微孢子虫的NbME...

• 出版日期2014
• 单位生命科学学院; 家蚕基因组生物学国家重点实验室; 遗传资源与进化国家重点实验室; 重庆师范大学; 西南大学